Desde o século XIX,  o Brasil é um polo de interesse para cientistas suíços, como o pesquisador Johann Jakob von Tschudi cujo trabalho, já na década de 1860, tornou-se  uma grande referência para a história sociocultural brasileira; o naturalista Louis Agassiz, que desbravou a Amazônia em 1865 e manteve uma intensa correspondência científica com o imperador Dom Pedro II; o zoólogo Emil August Goeldi, que escreveu em 1894 as primeiras obras fundamentais de zoologia do Brasil e permitiu que o Museu Paraense em Belém museu se estabelecesse como uma referência mundial em pesquisa sobre a Amazônia.

Na virada do século XX, o médico suíço Adolfo Lutz foi o fundador, juntamente com Oswaldo Cruz, do primeiro centro de medicina experimental e microbiologia. Ele desenvolveu os primeiros soros brasileiros antiofídicos, que foram produzidos pelo hoje Instituto Butantan.

Inspirado no sistema de aprendizagem da Suíça, o engenheiro suíço Roberto Mange esteve entre os fundadores em 1942 do Serviço Nacional de Aprendizagem Industrial – SENAI. A Fundação do suíço-brasileiro Paul Lemann contribui desde 2002 na implementação de projetos educacionais na rede pública atingindo mais de 3 milhões de estudantes e 200 mil professores em todo o Brasil.

Escolas suíças foram abertas no Rio (1963), em São Paulo (1965) e Curitiba (1979), oferecendo educação bilíngue e incentivando a experiência acadêmica, o pensamento crítico e a compreensão intercultural.

O Brasil é um país prioritário no âmbito acadêmico e da pesquisa. Desde os anos 1960, o governo suíço financiou cerca de 400 bolsas de estudo na Suíça para pesquisadores brasileiros, contribuindo para construir valiosas pontes entre as comunidades científicas dos dois países.

O acordo bilateral de Cooperação Científica e Tecnológica de 2009 tornou o Brasil um dos oito países prioritários em inovação para a Suíça. A rede Swissnex está presente no país desde 2014, com escritórios no Rio de Janeiro e São Paulo, para promover intercâmbios e colaborações de pesquisa e empreendedorismo científico.